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La regione di Hoenn è stata introdotta nella terza generazione dove sono ambientati i due giochi Pokémon Rubino e Pokémon Zaffiro. La regione è ispirata a Kyushu, una delle principali isole giapponesi, luogo di ricordi d’infanzia di Junichi Masuda, ideatore della regione e direttore dei giochi. La regione è equamente divisa tra zone terrestri e zone marittime e presenta con un clima prevalentemente tropicale.Come Kanto, Johto e Sinnoh è ispirata ad una regione giapponese, nello specifico il Kyūshū, luogo di infanzia del game director [[Junichi Masuda]]. ''Per approfondire vedi [[Hoenn]]'' 

Questa nuova modalità di lotta richiede una strategia diversa rispetto a quella delle lotte in singolo: alcune mosse possono colpire il Pokémon “alleato”, come ad esempio [[Terremoto ]] o [[Surf]], altre possono colpire entrambi i nemici come [[Frana]], ma bisogna tenere conto di molti altri fattori, come le [[abilità ]] dei propri Pokémon: [[Plusle ]] e [[Minum]], ad esempio, posseggono le abilità [[Più ]] e [[Meno]], che gli consentono di aumentare il loro [[Attacco Speciale ]] del 50% se sono presenti entrambi in campo.

Le '''Gare Pokémon ''' sono un tipologia di competizione introdotta in Pokémon Versione Rubino, Pokémon Versione Zaffiro e Pokémon Versione Smeraldo nella quale i mostriciattoli sono valutati in base a [[Virtù ]] e mosse. Per partecipare occorrono sia un [[Portapokémelle ]] che l’ambita [[Tessera Gare]], ottenibili rispettivamente negli edifici Gare di [[Porto Selcepoli ]] e [[Mentania]]. I Fiocchi sono dei riconoscimenti speciali che vengono assegnati ai mostriciattoli quando vincono una Gara Pokémon. 

La terza generazione ha introdotto le '''Nature''', una caratteristica che influenza due valori delle statistiche del Pokémon.

Le '''Pokémelle, introdotte con Pokémon Rubino e Zaffiro, ''' sono caramelle colorate di forma cubica utilizzate per aumentare una tra le cinque Virtù valutate nelle Gare Pokémon.Il loro utilizzo si estende anche alla [[Zona Safari ]] di Hoenn, nella quale diminuiscono le probabilità che un Pokémon fugga se lanciategli durante la lotta e attraggono esemplari di una certa Natura se inserite nelle '''Vaschette Pokémelle ''' presenti in varie zone.

Il [[Portapokémelle ]] è lo Strumento Base che le conserva e può essere ottenuto parlando con una ragazza nell’Arena delle Virtù di Porto Selcepoli.

Per creare la propria Base Segreta bisogna essere in possesso della MT43 Forzasegreta.Una volta in possesso della MT, sarà possibile creare la propria Base Segreta nei luoghi segreti nella regione di Hoenn.I luoghi segreti vengono raccolti in tre tipologie: Albero Piccolo, Albero Grande e Crepa nella roccia.